皇帝抓住机会，命令水师总兵方国安配合黑犀军主力和黄得功所部，三路夹击，左梦庚大败被杀，左军彻底失败。

左氏父子败亡之后，朝廷大军趁机攻占了武昌重镇，部署重病扼制长江中游。

平定江北四镇，以及御驾亲征击败左良玉父子，让皇帝朱常淓威望大涨，朝野之间称颂之声不绝于耳。

皇帝趁此机会，下令大力扩编新军，编练军队。

民间壮丁踊跃报名参军，各地富户乡绅也都纷纷捐款捐物，江南各地一片沸腾，朝廷威望逐步建立。

满清摄政王多尔衮此时并没有多余兵力南下江南，山西，山东两地的反清运动此起彼伏，让多尔衮焦头烂额。

而且，山西还有大量的大顺军，更是让满清朝廷忌惮不已。

山东各地民众自发组织起来，由各位乡绅带头组成义军，自己打造兵器，制造盔甲，旗帜，纷纷占领大顺军撤出后留下的福州县城。

满清排到山东的招抚特使也被义军驱逐，山东反清运动一时高涨。

在这种情况下，满清朝廷之中也出现了不同的声音，有人要求撤回关外，放弃京城，认为满清是无法与汉人抗衡的。

但是多尔衮固执己见，坚持认为满清有机会问鼎中原，一统江山，因此派遣其弟豫王铎铎带领一支人马进攻山东。

派遣其兄英亲王阿济格带领一支大军进攻山西，企图用武力稳定京畿两侧。

皇帝朱常淓审时度势，一面派人跟李自成联系，双方结盟，共同对抗满清。等到驱逐满清之后再决出天下归属。

李自成答应结盟，调集重病在山西与清军作战，将阿济格牵制在山西。

另一方面，皇帝则派出已经升为兵部侍郎的陈子龙为招抚大臣，赶赴山东招抚各路义军，授予各路义军首领官职头衔，使他们为朝廷所用。同时向山东和河南派出流官管理。

第二，则是派遣兵部尚书史可法在中原之地招抚收拢溃兵败将，重新占领大顺军留下的权力真空。

而且，朝廷还宣布免除以上地区的两年税赋，一时间两省百姓欢呼雷动，拥戴朝廷。

陈子龙带着收拢的各路义军，重新编组，由朝廷供给兵器甲胄以及粮草，与多铎带领的清军进行了多次战斗。

清军人少，又不熟悉地形，被义军折磨的焦头烂额，最终损失惨重，只好退出山东。

阿济格在山西也是损兵折将，节节败退。大顺军士气大振，趁势反击，清军不敌，只好退出山西。

大顺军忙着收服失地，南明朝廷也需要时间消化光复的山东河南等地，满清朝廷也要舔舐伤口，没有余力再次出兵，而且内部的争论分裂越来越严重，因此三方一时之间暂时维持了一个微妙的平衡状态。